O Instituto do Carste tem como principal missão realizar ações de investigação e preservação das áreas cársticas brasileiras.
As principais metas do Instituto do Carste são:
- estudar o patrimônio natural e cultural relacionado a ambientes cársticos;
- Apoiar iniciativas que levem à preservação do patrimônio natural e cultural em áreas cársticas;
- Conceber, incentivar e apoiar a publicação de material de qualidade relacionado aos ambientes cársticos e seu entorno;
- Conceber, incentivar e apoiar ações de educação ambiental relacionadas ao carste e seu entorno;
- Promover e intermediar o intercambio e a colaboração com instituiçoes nacionais e estrangeiras;
- Promover e apoiar eventos (palestras, exposições, entre outros) relacionados com o carste e seu entorno;
- Difundir informações e iniciativas relacionadas ao carste, assim como sua importância e necessidade de preservação.